2002年，学校响应国家政策推动高等学校实验教学改革，根据人才实践能力和创新能力培养要求，以实验教学体系改革为核心，对实验室资源进行整合、优化和重组，建成生物学实验教学中心，并于当年顺利通过教育部的教学合格评估。2004年，中心获省教育厅“教育专项”支持，2006年获“山东省高校骨干学科教学实验室强化建设项目”。2010年，中心整体搬迁至12号楼C栋，总面积9000余m²，并依托生物工程专业，建设啤酒、红酒中试车间。2011年，中心获批省高等学校实验教学示范中心建设单位。2018年，中心依托专业获批省教育服务新旧动能转换专业对接产业项目，经费3600万元，一大批功能先进的大中型设备进入生物学实验教学中心。中心目前拥有透射电子显微镜、扫描电子显微镜等5300余万元仪器设备，可在群体、个体、细胞和分子水平上开展生物学及相关领域的科学研究工作。中心依托专业生物科学专业为国家级特色专业和国家一流专业建设点，生物工程专业为山东省一流专业建设点。近几年，依托本实验教学中心，分别获批省工程研究中心、省教育厅工程研究中心、市重点实验室等市厅级以上科研平台7个。如今，本实验教学中心已成为鲁东大学培养创新性、复合型应用人才的重要基地。